Pueden ser permanentes o especiales y están integradas por tres consejerías y también por representantes de los partidos políticos.
Para garantizar la aplicación de las disposiciones legales en la materia; supervisar la correcta gestión de los recursos y asegurar la transparencia en los procesos electorales, el Consejo General del Instituto Electoral del Estado de México (IEEM) conforma Comisiones Electorales Permanentes y Especiales.
Dichas comisiones deben estar integradas por tres Consejeras y personas representantes de los partidos políticos, quienes se hacen cargo, entre otros puntos, de vigilar el cumplimiento del Reglamento de Comisiones del Consejo General del Instituto, y de promover los principios rectores del IEEM que son: certeza; imparcialidad; independencia; legalidad; máxima publicidad; objetividad y paridad.
Tras la asignación de tres nuevas Consejerías por parte del Instituto Nacional Electoral (INE), el Consejo General del IEEM aprobó la nueva integración de las comisiones, que para este periodo son siete permanentes y cinco especiales.
Las permanentes son:
La Comisión de Organización que supervisa aspectos logísticos en las elecciones, como: la instalación de casillas; la distribución de material electoral, y la gestión de juntas distritales y municipales. Presidida por la Consejera Electoral, Paula Melgarejo Salgado y se conforma por las Consejeras Electorales: Patricia Lozano Sanabria y July Erika Armenta Paulino.
La Comisión de Vigilancia de las Actividades Administrativas y Financieras que asegura la correcta administración de los recursos del IEEM, está integrada por las Consejeras Electorales Patricia Lozano Sanabria, July Erika Armenta Paulino y Karina Ivonne Vaquera Montoya, quien es la Presidenta.
La Comisión de Acceso a Medios, Propaganda y Difusión se encarga de definir estrategias para la divulgación de la cultura democrática, monitorear campañas electorales y fomentar la educación cívica, entre otras. Para esta etapa está encabezada por la Consejera Electoral Sayonara Flores Palacios y se integra por las Consejeras Electorales: Patricia Lozano Sanabria y Flor Angeli Vieyra Vázquez.
La Comisión de Promoción y Difusión de la Cultura Política y Democrática, enfocada en difundir la participación ciudadana y la educación democrática, a través de programas y campañas; es presidida por la Consejera Electoral, Patricia Lozano Sanabria, y se conforma por las Consejeras Electorales: Sayonara Flores Palacios y Flor Angeli Vieyra Vázquez.
La Comisión de Seguimiento al Servicio Profesional Electoral Nacional (SPEN) supervisa el desarrollo y cumplimiento del programa SPEN y busca profesionalizar a las y los servidores públicos electorales. La Consejera Electoral Karina Ivonne Vaquera Montoya es la Presidenta y las Consejeras Electorales: Sayonara Flores Palacios y July Erika Armenta Paulino, forman parte de esta.
La Comisión de Igualdad de Género y No Discriminación garantiza la igualdad de derechos político-electorales entre hombres y mujeres, y combate cualquier forma de discriminación. Su Presidenta es la Consejera Electoral Flor Angeli Vieyra Vázquez y se integra por las Consejeras Electorales, Paula Melgarejo Salgado y Karina Ivonne Vaquera Montoya.
Las comisiones especiales son:
La Comisión Especial de Vinculación con el INE que se encarga de coordinar la colaboración con el IEEM durante los procesos electorales, y está presidida la Consejera Electoral, Patricia Lozano Sanabria, y conformada por las Consejeras Electorales, Paula Melgarejo Salgado y Sayonara Flores Palacios.
La Comisión Especial para la Atención del Programa de Resultados Electorales Preliminares (PREP) que supervisa la implementación del PREP, y garantiza que los resultados preliminares de las elecciones sean precisos y confiables, queda a cargo de las Consejeras Electorales Paula Melgarejo Salgado, Patricia Lozano Sanabria y July Erika Armenta Paulino quien es la Presidenta.
La Comisión de Vinculación con Órganos Desconcentrados del IEEM que supervisa la instalación y funcionamiento de las juntas distritales y municipales, y participa en la designación de vocalías y consejerías electorales. Está presidida por la Consejera Electoral, Karina Ivonne Vaquera Montoya y las Consejeras Electorales: Paula Melgarejo Salgado y Sayonara Flores Palacios son integrantes.
La Comisión Especial para el Voto de Mexiquenses que radican en el Extranjero, que es la encargada de facilitar la participación de quienes viven fuera el país, gestionando su derecho, está encabezada por la Consejera Electoral Karina Ivonne Vaquera Montoya y las Consejeras Electorales Paula Melgarejo Salgado y July Erika Armenta Paulino son parte de ella.
En la Comisión Especial Dictaminadora del Registro de Partidos Políticos, responsable de auxiliar al Consejo General en las actividades relativas al procedimiento de constitución y registro de las organizaciones ciudadanas como partidos políticos locales, participan como Presidenta la Consejera Electoral, Patricia Lozano Sanabria y las Consejeras Electorales: Paula Melgarejo Salgado y Flor Angeli Vieyra Vázquez.
Finalmente, la Comisión Especial para la Revisión y Actualización de la Normatividad del IEEM que tiene como función revisar y actualizar los reglamentos y lineamientos internos del Instituto, está presidida por la Consejera Electoral, Paula Melgarejo Salgado y conformada las Consejeras Electorales, Patricia Lozano Sanabria y Karina Ivonne Vaquera Montoya.